Etelä-Afrikan uusi koronaviruksen varianttikanta 501Y-V2
18. joulukuuta 2020 Etelä-Afrikka havaitsi uuden koronaviruksen 501Y-V2-mutantin.Nyt eteläafrikkalainen mutantti on levinnyt yli 20 maahan.Kokeet ovat osoittaneet, että edellä mainitut New Corona-virus -mutantit voivat sisältää muita uuden koronaviruksen K417N/T-, E484K- ja N501Y-mutaatioita, jotka voivat vähentää rokotteen aiheuttamien plasmaa neutraloivien vasta-aineiden neutralointikykyä.Kuitenkin verrattuna vertailugenomiin Wuh01 (sekvenssinumero MN908947), Etelä-Afrikan mutanttigenomisekvenssin 501Y.V2:ssa on 23 nukleotidivarianttia.Siinä on sama N501Y-mutaatio kuin Ison-Britannian mutantin B.1.1.7-alatyypissä, mutta se sisältää silti mutaatioita S-proteiinin kahdessa avainkohdassa E484K ja K417N, joilla on mahdollisesti merkittäviä vaikutuksia viruksen kykyyn tartuttaa.
Uusi koronavirus on yksijuosteinen RNA-virus, jonka genomimutaatiot ovat yleisempiä.Yhden kohteen havaitseminen voi helposti johtaa sellaisten näytteiden havaitsematta jättämiseen, joissa on alhainen viruskuorma ja mutatoituneet viruskannat.Uudelleentarkastelunopeus yksittäisen positiivisen kohteen havaitsemisessa voi nousta yli 10 %:iin, mikä voi lisätä työmäärää ja pidentää diagnoosiaikaa.Kunkin kohteen tulosten monitasoiset havaitseminen ja keskinäinen todentaminen voivat lisätä havaitsemisnopeutta ja helpottaa varhaisen diagnoosin.
Kuva 1. Kaaviokaavio uuden koronaviruksen tartuntamekanismista
Britannian uusi koronavirusmutantti B.1.1.7
26. joulukuuta 2020 B.1.1.7 -kannan ensimmäinen tieteellinen paperi julkaistiin verkossa.Lontoon Hygienen yliopiston instituutti ja trooppiset sairaudet vahvistivat, että B.1.1.7 -kanta kykenee leviämään enemmän kuin muut kannot, mikä oli yli 56% (95% CI 50-74%).Koska tällä uudella mutanttikantalla on selvempi siirtoteho, COVID-19: n hallinta on vaikeampaa.Seuraavana päivänä Birminghamin yliopisto Yhdistyneessä kuningaskunnassa latasi artikkelin MedRxivistä.Tutkimuksessa havaittiin, että ORF1ab- ja N-virusgeenikopioiden määrä B.1.1.7-mutanttikannalla (S-geenin poisjääminen) infektoituneilla potilailla kasvoi merkittävästi;tätä ilmiötä seurattiin väestössä.Tämä artikkeli huomauttaa, että Ison -Britannian mutantti B.1.1.7 -tapahtuman tartunnan saaneilla potilailla on huomattavasti korkeampi viruskuorma, joten tämä mutantti voi myös olla patogeenisempi.
Kuva 2. Ison-Britannian koronaviruksen mutanttikannan B.1.1.7 sisältämä genomimutaatiosekvenssi
Kuva 3. N501Y -mutaatio tapahtui sekä Britanniassa että eteläafrikkalaisessaVaihtoehdot
Uusien koronaviruksen varianttien tunnistussarja
Chuangkun Biotech Inc. on onnistuneesti kehittänyt havaitsemisarjan B.1.1.7: lle ja 501Y-V2: lle uusille koronavirusvarianteille.
Tämän tuotteen edut: korkea herkkyys, 4 kohteen samanaikainen havaitseminen, jotka kattavat B.1.1.7-mutanttikannan ja eteläafrikkalaisen mutanttikannan 501Y.V2 tärkeimmät mutaatiokohdat.Tämä pakkaus voi samanaikaisesti havaita N501Y-, HV69-70del-, E484K-mutaatiokohdat ja uuden koronaviruksen S-geenin;Nopea testi: näytteen ottamisesta tulokseen kestää vain 1 tunti 30 minuuttia.
Kuva 4. COVID-19 Britannian varianttivahvistuskäyrän havaitseminen
Kuva 5. COVID-19 Etelä-Afrikan varianttivahvistuskäyrän havaitseminen
Kuva 6. Villityyppi uuden koronaviruksen vahvistuskäyrästä
Ei ole selvää, miten nämä mutaatiot keräävät uusia pitkän aikavälin vaikutuksia pandemian COVID-19-oikeuteen.Mutta tämä muistuttaa meitä siitä, että nämä mutaatiot voivat vaikuttaa luonnollisen immuniteetin ja rokotuksen aikaansaaman immuniteetin tehokkuuteen.Se muistuttaa meitä myös siitä, että meidän on seurattava jatkuvasti uutta koronavirusta pitkään ja päivitettävä COVID-19-rokote, jotta voimme käsitellä uuden koronaviruksen kehitystä.
Postitusaika: 12.3.2021